第一、工作原理不同：齿轮泵靠齿轮啮合传动来实现吸油和排油的，柱塞泵靠利用柱塞与缸体的相对滑动来实现吸油和排油的。
第二、结构不同：齿轮泵没有配流装置，柱塞泵必须有配流盘或配流轴。
第三、工作环境不同：齿轮泵可以在比较恶劣的环境工作，抗污染能力强，但压力和效率偏低。噪声最大；柱塞泵抗污染能力低，容易堵塞，但压力和效率很高。
第四、价格不同；齿轮泵便宜，柱塞泵贵。